pracownik naukowo-techniczny
Cyfronet, AGH UST Academic Computer Centre ACK-zwe
ORCID: brak
ResearcherID: brak
Scopus: brak
System Informacyjny AGH (SkOs)
A distributed multiscale computation of a tightly coupled model using the Multiscale Modeling Language / Joris Borgdorff, [et al.], Katarzyna RYCERZ, Eryk CIEPIELA, Tomasz GUBAŁA, Daniel HARĘŻLAK, Marian BUBAK, [et al.] // Procedia Computer Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1877-0509. — 2012 vol. 9, s. 596–605. — Bibliogr. s. 605, Abstr.. — Proceedings of the International Conference on Computational Science, ICCS 2012
keywords: multi-scale modelling, MML, in stent restenosis, MUSCLE, QCG-Broker, Gridspace, distributed multi-scale computing, multi-scale modelling language
Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Katarzyna Rycerz, Tomasz Gubała, Eryk Ciepiela
cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1016/j.procs.2012.04.064
A lightweight method of metadata and data management with DataNet / Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Maciej PAWLIK,Bartosz WILK, Marian BUBAK // W: eScience on distributed computing infrastructure : achievements of PLGrid Plus domain-specific services and tools / eds. Marian Bubak, Jacek Kitowski, Kazimierz Wiatr. — Switzerland : Springer International Publishing, cop. 2014 + CD. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 8500. Information Systems and Applications, incl. Internet/Web, and HCI). — ISBN: 978-3-319-10893-3 ; e-ISBN: 978-3-319-10894-0. — S. 164–177. — Bibliogr. s. 175–177, Abstr.
keywords: data management, metadata recording, storage infrastructures, data sharing, reproducibility, discoverability
Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Marek Kasztelnik, Maciej Pawlik, Bartosz Wilk
cyfrowy identyfikator dokumentu:
Cloud computing infrastructure for the VPH community / Piotr NOWAKOWSKI, Marian BUBAK, Tomasz BARTYŃSKI, Tomasz GUBAŁA, Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Maciej MALAWSKI, Jan MEIZNER // Journal of Computational Science ; ISSN 1877-7503. — 2018 vol. 24, s. 169–179. — Bibliogr. s. 178–179, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2017-06-21. — M. Bubak, M. Malawski – dod. afiliacja: ACC Cyfronet AGH. — tekst: https://www-1sciencedirect-1com-1000027eh02cb.wbg2.bg.agh.edu.pl/science/article/pii/S1877750317307330/pdfft?md5=942e1421b9d5beee97b74563b8470338&pid=1-s2.0-S1877750317307330-main.pdf
keywords: e-science, cloud computing, virtualization, distributed scientific infrastructures
Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Maciej Malawski, Piotr Nowakowski, Tomasz Gubała, Marek Kasztelnik, Tomasz Bartyński, Jan Meizner
cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1016/j.jocs.2017.06.012
Comparison of cloud and local HPC approach for MUSCLE-based multiscale simulations / Katarzyna RYCERZ, Marcin NOWAK, Paweł Pierzchała, Eryk CIEPIELA, Daniel HARĘŻLAK, Marian BUBAK // W: 7th IEEE international conference on e-Science [Dokument elektroniczny] : 5th-8\textsuperscript{th} December 2011, Stockholm, Sweden : workshop proceedings / IEEE. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — [Sweden : CPS Conference Publishing Service], [2011]. — 1 dysk optyczny. — e-ISBN: 978-0-7695-4598-1. — S. 81–88. — Wymagania systemowe: Adobe Acrobat Reader ; napęd CD-ROM. — Bibliogr. s. 87–88, Abstr.. — Tyt. przejęto ze s. tyt. (po wybraniu opcji: Papers by Author). — M. Bubak – dod. afiliacja: University of Amsterdam, The Netherlands
brak zdefiniowanych słów kluczowych
Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Marcin Nowak, Katarzyna Rycerz, Eryk Ciepiela
Composing, execution and sharing of multiscale applications / Katarzyna RYCERZ, Marian BUBAK, Eryk CIEPIELA, Daniel HARĘŻLAK, Tomasz GUBAŁA, Jan MEIZNER, Maciej PAWLIK, Bartosz WILK // Future Generation Computer Systems ; ISSN 0167-739X. — 2015 vol. 53, s. 77–87. — Bibliogr. s. 86–87, Abstr.. — tekst: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0167739X15002034/pdfft?md5=82dd29e13baaed7b4ed16284a7913b9a&pid=1-s2.0-S0167739X15002034-main.pdf
keywords: multi-scale modelling, e-infrastructures, tools and environments, multi-scale simulations, distributed multi-scale computing
Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Katarzyna Rycerz, Tomasz Gubała, Eryk Ciepiela, Jan Meizner, Maciej Pawlik, Bartosz Wilk
cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1016/j.future.2015.06.002
Dedicated IT infrastructure for smart levee monitoring and flood decision support / Bartosz BALIŚ, Tomasz BARTYŃSKI, Robert BRZOZA-WOCH, Marian BUBAK, Daniel HARĘŹLAK, Marek KASZTELNIK, Marek KONIECZNY, Bartosz KWOLEK, Maciej MALAWSKI, Piotr NAWROCKI, Piotr NOWAKOWSKI, Tomasz SZYDŁO, Bartosz WILK, Krzysztof ZIELIŃSKI // E3S Web of Conferences [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 2267-1242. — 2016 vol. 7 art. no. 14008, s. 1–10. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Tryb dostępu: https://goo.gl/bRuafq [2016-12-07]. — Bibliogr. s. 9–10, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2016-10-20. — FLOODrisk 2016 : 3\textsuperscript{rd} European conference on Flood Risk Management : October 17–21, 2016, Lyon, France
Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Krzysztof Zieliński, Piotr Nawrocki, Bartosz Baliś, Maciej Malawski, Bartosz Kwolek, Piotr Nowakowski, Tomasz Szydło, Marek Kasztelnik, Tomasz Bartyński, Robert Brzoza-Woch, Bartosz Wilk, Marek Konieczny
cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1051/e3sconf/20160714008
Dedicated IT infrastructure for Smart Levee Monitoring and Flood Decision Support / Bartosz BALIŚ, Tomasz BARTYŃSKI, Robert BRZOZA-WOCH, Marian BUBAK, Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Marek KONIECZNY, Bartosz KWOLEK, Maciej MALAWSKI, Piotr NAWROCKI, Piotr NOWAKOWSKI, Tomasz SZYDŁO, Bartosz WILK, Krzysztof ZIELIŃSKI // W: FLOODrisk 2016 : 3rd European conference on Flood risk management : 18th–20th October 2016, Lyon, France : book of abstracts / eds. Michel Lang, Frans Klijn, Paul Samuels. — [France : s. n.], [2016]. — S. 271
Distributed multiscale computations using the MAPPER framework / Mohamed Ben Belgacem, Bastien Chopard, Joris Borgdorff, Mariusz Mamoński, Katarzyna RYCERZ, Daniel HARĘŻLAK // Procedia Computer Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1877-0509. — 2013 vol. 18, s. 1106–1115. — Bibliogr. s. 1114–1115, Abstr.. — ICCS 2013 : International Conference on Computational Science. — tekst: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1877050913004195/pdf?md5=c57879f91419e9a7dcbed57542a6a3f0&pid=1-s2.0-S1877050913004195-main.pdf
keywords: Grid, application, distributed, computation, MAPPER framework, multi-scale
Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Katarzyna Rycerz
cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1016/j.procs.2013.05.276
Enabling multiscale fusion simulations on distributed computing resources / Katarzyna RYCERZ, Marian BUBAK, Eryk CIEPIELA, Maciej PAWLIK, Olivier Hoenen, Daniel HARĘŻLAK, Bartosz WILK, Tomasz GUBAŁA, Jan MEIZNER, David Coster // W: eScience on distributed computing infrastructure : achievements of PLGrid Plus domain-specific services and tools / eds. Marian Bubak, Jacek Kitowski, Kazimierz Wiatr. — Switzerland : Springer International Publishing, cop. 2014 + CD. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 8500. Information Systems and Applications, incl. Internet/Web, and HCI). — ISBN: 978-3-319-10893-3 ; e-ISBN: 978-3-319-10894-0. — S. 195–210. — Bibliogr. s. 207–210, Abstr.
keywords: distributed computing, fusion, workflow, e-infrastructures, multi-scale, tools and environments, multi-physics
InSilicoLab – managing complexity of chemistry computations / Joanna KOCOT, Tomasz SZEPIENIEC, Daniel HARĘŻLAK, Klemens NOGA, Mariusz STERZEL // W: Building a national distributed e-infrastructure – PL-Grid : scientific and technical achievements / eds. Marian Bubak, Tomasz Szepieniec, Kazimierz Wiatr. — Berlin ; Heidelberg : Springer-Verlag, cop. 2012. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 7136. Information Systems and Applications, incl. Internet/Web, and HCI). — Na okł. dod.: State-of-the-art survey ; Applications, Development and execution tools, VO and security systems, Basic services, Grid resources. — ISBN: 978-3-642-28266-9. — S. 265–275. — Bibliogr. s. 274–275, Abstr.
Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Tomasz Szepieniec, Mariusz Sterzel, Joanna Kocot, Klemens Noga
Integrating various grid middleware components and user services into a single platform / Marcin RADECKI, Tadeusz SZYMOCHA, Daniel HARĘŻLAK, Maciej PAWLIK, Jakub ANDRZEJEWSKI, Wojciech ZIAJKA, Marcin SZELC // W: Building a national distributed e-infrastructure – PL-Grid : scientific and technical achievements / eds. Marian Bubak, Tomasz Szepieniec, Kazimierz Wiatr. — Berlin ; Heidelberg : Springer-Verlag, cop. 2012. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 7136. Information Systems and Applications, incl. Internet/Web, and HCI). — Na okł. dod.: State-of-the-art survey ; Applications, Development and execution tools, VO and security systems, Basic services, Grid resources. — ISBN: 978-3-642-28266-9. — S. 15–26. — Bibliogr. s. 25–26, Abstr.
Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marcin Radecki, Wojciech Ziajka, Tadeusz Szymocha, Jakub Andrzejewski, Marcin Szelc, Maciej Pawlik
Managing entire lifecycles of e-science applications in the GridSpace2 virtual laboratory – from motivation through idea to operable Web-accessible environment built on top of PL-Grid e-infrastructure / Eryk CIEPIELA, Piotr NOWAKOWSKI, Joanna KOCOT, Daniel HARĘŻLAK, Tomasz GUBAŁA, Jan MEIZNER, Marek KASZTELNIK, Tomasz BARTYŃSKI, Maciej MALAWSKI, Marian BUBAK // W: Building a national distributed e-infrastructure – PL-Grid : scientific and technical achievements / eds. Marian Bubak, Tomasz Szepieniec, Kazimierz Wiatr. — Berlin ; Heidelberg : Springer-Verlag, cop. 2012. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 7136. Information Systems and Applications, incl. Internet/Web, and HCI). — Na okł. dod.: State-of-the-art survey ; Applications, Development and execution tools, VO and security systems, Basic services, Grid resources. — ISBN: 978-3-642-28266-9. — S. 228–239. — Bibliogr. s. 238–239, Abstr.. — T. Gubała, M. Bubak – dod. afiliacja: University of Amsterdam
Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Maciej Malawski, Piotr Nowakowski, Tomasz Gubała, Marek Kasztelnik, Tomasz Bartyński, Eryk Ciepiela, Joanna Kocot, Jan Meizner
Scripting language extensions offered by the GridSpace experiment platform / Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Eryk CIEPIELA, Marian BUBAK // W: Building a national distributed e-infrastructure – PL-Grid : scientific and technical achievements / eds. Marian Bubak, Tomasz Szepieniec, Kazimierz Wiatr. — Berlin ; Heidelberg : Springer-Verlag, cop. 2012. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 7136. Information Systems and Applications, incl. Internet/Web, and HCI). — Na okł. dod.: State-of-the-art survey ; Applications, Development and execution tools, VO and security systems, Basic services, Grid resources. — ISBN: 978-3-642-28266-9. — S. 217–227. — Bibliogr. s. 226–227, Abstr.
Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Marek Kasztelnik, Eryk Ciepiela
Smart levee monitoring and flood decision support system: reference architecture and urgent computing management / Bartosz BALIŚ, Tomasz BARTYŃSKI, Marian BUBAK, Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Maciej MALAWSKI, Piotr NOWAKOWSKI, Maciej PAWLIK, Bartosz WILK // Procedia Computer Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1877-0509. — 2017 vol. 108, s. 2220–2229. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 2228–2229, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2017-06-09. — ICCS 2017 : International Conference on Computational Science : 12–14 June 2017, Zurich, Switzerland. — tekst: https://goo.gl/a5dXx1
keywords: urgent computing, flood decision support, smart levee monitoring, reference architecture
Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Bartosz Baliś, Maciej Malawski, Piotr Nowakowski, Marek Kasztelnik, Tomasz Bartyński, Maciej Pawlik, Bartosz Wilk
cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1016/j.procs.2017.05.192
Support for multiscale simulations with molecular dynamics / Katarzyna RYCERZ, Eryk CIEPIELA, Grzegorz DYK, Derek Groen, Tomasz GUBAŁA, Daniel HARĘŻLAK, Maciej PAWLIK, [et al.], Marian BUBAK // Procedia Computer Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1877-0509. — 2013 vol. 18, s. 1116–1125. — Bibliogr. s. 1124–1125, Abstr.. — ICCS 2013 : International Conference on Computational Science. — tekst: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1877050913004201/pdf?md5=01a4f0da6bcad6218dec757c80024bb6&pid=1-s2.0-S1877050913004201-main.pdf
keywords: e-infrastructures, tools, distributed multi-scale simulations
Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Katarzyna Rycerz, Tomasz Gubała, Eryk Ciepiela, Maciej Pawlik, Grzegorz Dyk
cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1016/j.procs.2013.05.277
The collage authoring environment: from proof-of-concept prototype to pilot service / Eryk CIEPIELA, Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Jan MEIZNER, Grzegorz DYK, Piotr NOWAKOWSKI, Marian BUBAK // Procedia Computer Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1877-0509. — 2013 vol. 18, s. 769–778. — Bibliogr. s. 778, Abstr.. — M. Bubak – dod. afiliacja: University of Amsterdam. — ICCS 2013 : 13\textsuperscript{th} annual International Conference on Computational Science : 5th–7th June 2013, Barcelona, Spain. — tekst: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1877050913003840/pdf?md5=4896b2fbe119c01a65840334c4d5faf3&pid=1-s2.0-S1877050913003840-main.pdf
keywords: open science, scientific publishing, executable scientific publications, reproducible science
Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Piotr Nowakowski, Marek Kasztelnik, Eryk Ciepiela, Jan Meizner, Grzegorz Dyk
cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1016/j.procs.2013.05.241
The Collage Authoring Environment / Piotr NOWAKOWSKI, Eryk CIEPIELA, Daniel HARĘŻLAK, Joanna KOCOT, Marek KASZTELNIK, Tomasz BARTYŃSKI, Jan MEIZNER, Grzegorz Dyk, Maciej MALAWSKI // Procedia Computer Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1877-0509. — 2011 vol. 4 spec. iss., s. 608–617. — Bibliogr. s. 617, Abstr.. — Dod. afiliacja M. Malawski: Center for Research Computing, University of Notre Dame, USA. — W spisie treści informacja: Original Research Article. — ICCS 2011 : proceedings of the International Conference on Computational Science : Singapore, Japan, June 1–3, 2011
keywords: high performance computing, scientific publishing, executable paper, e-Science
Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Maciej Malawski, Piotr Nowakowski, Marek Kasztelnik, Tomasz Bartyński, Eryk Ciepiela, Joanna Kocot, Jan Meizner
cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1016/j.procs.2011.04.064
Towards an operational database for real-time environmental monitoring and early warning systems / Bartosz BALIŚ, Marian BUBAK, Daniel HARĘŻLAK, Piotr NOWAKOWSKI, Maciej PAWLIK, Bartosz WILK // Procedia Computer Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1877-0509. — 2017 vol. 108, s. 2250–2259. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 2259, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2017-06-09. — ICCS 2017 : International Conference on Computational Science : 12–14 June 2017, Zurich, Switzerland. — tekst: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1877050917307846/pdf?md5=b9b8df45fb907680c241be0e26fbd30b&pid=1-s2.0-S1877050917307846-main.pdf
keywords: environmental monitoring, smart levee monitoring, time series data, operational database
Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Bartosz Baliś, Piotr Nowakowski, Maciej Pawlik, Bartosz Wilk
cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1016/j.procs.2017.05.193
Towards provisioning of reproducible, reviewable and reusable in-silico experiments with the GridSpace2 platform / Eryk CIEPIELA, Bartosz WILK, Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Maciej PAWLIK, Marian BUBAK // W: eScience on distributed computing infrastructure : achievements of PLGrid Plus domain-specific services and tools / eds. Marian Bubak, Jacek Kitowski, Kazimierz Wiatr. — Switzerland : Springer International Publishing, cop. 2014 + CD. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 8500. Information Systems and Applications, incl. Internet/Web, and HCI). — ISBN: 978-3-319-10893-3 ; e-ISBN: 978-3-319-10894-0. — S. 118–129. — Bibliogr. s. 127–129, Abstr.. — M. Bubak – dod. afiliacja: University of Amsterdam
keywords: e-science, distributed computing, problem solving environments, in silico experiments, reproducibility
Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Marek Kasztelnik, Eryk Ciepiela, Maciej Pawlik, Bartosz Wilk