A framework for domain-specific science gateways / J. KOCOT, T. SZEPIENIEC, M. STERZEL, M. GOLIK, P. WÓJCIK, T. TWARÓG, T. GRABARCZYK // W: Cracow'13 Grid Workshop : November 4–6, 2013, Krakow, Poland : proceedings / eds. Marian Bubak, Michał Turała, Kazimierz Wiatr. — Kraków : Academic Computer Centre CYFRONET AGH, 2013. — ISBN: 978-83-61433-08-8. — S. 93–94. — Bibliogr. s. 94

A framework for domain-specific science gateways / Joanna KOCOT, Tomasz SZEPIENIEC, Piotr WÓJCIK, Michał TRZECIAK, Maciej GOLIK, Tomasz GRABARCZYK, Hubert SIEJKOWSKI, Mariusz STERZEL // W: eScience on distributed computing infrastructure : achievements of PLGrid Plus domain-specific services and tools / eds. Marian Bubak, Jacek Kitowski, Kazimierz Wiatr. — Switzerland : Springer International Publishing, cop. 2014 + CD. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 8500. Information Systems and Applications, incl. Internet/Web, and HCI). — ISBN: 978-3-319-10893-3 ; e-ISBN: 978-3-319-10894-0. — S. 130–146. — Bibliogr. s. 145–146, Abstr.

A platform for collaborative e-science applications / Marian BUBAK, Tomasz GUBAŁA, Maciej MALAWSKI, Bartosz BALIŚ, Włodzimierz FUNIKA, Tomasz BARTYŃSKI, Eryk CIEPIELA, Daniel Harężlak, Marek KASZTELNIK, Joanna KOCOT, Dariusz Król, Piotr NOWAKOWSKI, [et al.] // W: KU KDM 2009 : druga konferencja użytkowników komputerów dużej mocy : Zakopane, March 12–13, 2009 : abstracts / ACK Cyfronet AGH. — Kraków : ACK Cyfronet AGH, 2009. — Opis częśc. wg okł.. — S. 7–9. — Bibliogr. s. 9

Applying workflows to scientific projects represented in file system directory tree / Mieszko Makuch, Maciej MALAWSKI, Joanna KOCOT, Tomasz SZEPIENIEC // W: WORKS 2020 [Dokument elektroniczny] : proceedings of the 15th Workshop on Workflows in Support of Large-Scale Science conjunction with SC20: the international conference for High Performance Computing, Networking, Storage and Analysis : virtual conference, November 9-19, 2020. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — Piscataway : The Institute of Electrical and Electronics Engineers, cop. 2020. — e-ISBN: 978-1-6654-0452-5. — S. 25–32. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 32, Abstr.. — tekst: https://ieeexplore-1ieee-1org-1000047vq0064.wbg2.bg.agh.edu.pl/stamp/stamp.jsp?tp=&arnumber=9308147

Centre for new methods in computational diagnostics and personalized therapy / Marian BUBAK, Bartosz BALIŚ, Tomasz BARTYŃSKI, Eryk CIEPIELA, Grzegorz DYK, Tomasz GUBAŁA, Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Joanna KOCOT, Maciej MALAWSKI, Jan MEIZNER, Piotr NOWAKOWSKI, Maciej PAWLIK, Katarzyna RYCERZ, Paweł SUDER, Tomasz SZEPIENIEC, Bartosz WILK // W: CGW Workshop'17 : Kraków, Poland, October 23-25, 2017 : proceedings / eds. Marian Bubak, Michał Turała, Kazimierz Wiatr. — Kraków : Academic Computer Centre CYFRONET AGH, [2017]. — ISBN: 978-83-61433-24-8. — S. 67–68. — Bibliogr. s. 68. — Toż. na: {http://www.eurvalve.eu/wp-content/uploads/2017/11/Cyfronet-%C5%9Brodek_Proceedings.pdf}. — Dod. na stronie konferencji prezentacja {http://www.cyfronet.krakow.pl/cgw17/presentations/S8_5-M-Bubak.pdf}

Cherenkov Telescope Array data management / Giovanni Lamanna, [et al.], Hubert SIEJKOWSKI, [et al.], Joanna KOCOT, [et al.], Tomasz SZEPIENIEC, [et al.] // W: ICRC2015 [Dokument elektroniczny] : the astroparticle physics conference : 34\textsuperscript{th} International Cosmic Ray Conference : July 30–August 6, 2015 : the Hague, the Netherlands : book of abstracts. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — [The Hague : s. n.], [2015]. — S. 322–323. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Tryb dostępu: https://indico.cern.ch/event/344485/book-of-abstracts.pdf [2018-04-07]

Cherenkov Telescope Array data management / G. Lamanna, [et al.], J. KOCOT, [et al.], H. SIEJKOWSKI, [et al.], T. SZEPIENIEC, [et al.] // PoS Proceedings of Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1824-8039. — 2015 vol. 236 art. no. 947, s. 1–8. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 8. — Publikacja dostępna online od: 2016-08-18. — ICRC2015 : the astroparticle physics conference : 34\textsuperscript{th} International Cosmic Ray Conference : July 30–August 6, 2015 : The Hague, The Netherlands. — tekst: https://pos.sissa.it/236/947/pdf

Comprehensive support for chemistry computations in PL-Grid infrastructure / Andrzej Eilmes, Mariusz STERZEL, Tomasz SZEPIENIEC, Joanna KOCOT, Klemens NOGA, Maciej GOLIK // W: eScience on distributed computing infrastructure : achievements of PLGrid Plus domain-specific services and tools / eds. Marian Bubak, Jacek Kitowski, Kazimierz Wiatr. — Switzerland : Springer International Publishing, cop. 2014 + CD. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 8500. Information Systems and Applications, incl. Internet/Web, and HCI). — ISBN: 978-3-319-10893-3 ; e-ISBN: 978-3-319-10894-0. — S. 250–262. — Bibliogr. s. 262, Abstr.

Comprehensive support for chemistry computations within PL-Grid Plus and PL-Grid NG projects / A. Eilmes, J. KOCOT, M. Makowski, G. Mazur, K. NOGA, M. STERZEL // W: CGW workshop'14 : October 27–29, 2014, Krakow, Poland : proceedings / eds. Marian Bubak, Michał Turała, Kazimierz Wiatr. — Kraków : Academic Computer Centre CYFRONET AGH, 2014. — ISBN: 978-83-61433-10-1. — S. 101–102. — Bibliogr. s. 102

Environment for collaborative e-science applications: CGW08 tutorial / T. BARTYŃSKI, M. BUBAK, T. GUBAŁA, D. Harężlak, M. KASZTELNIK, J. KOCOT, P. NOWAKOWSKI // W: Cracow'08 Grid Workshop : October 13–15, 2008 Cracow, Poland : proceedings / eds. Marian Bubak, Michał Turała, Kazimierz Wiatr. — [Kraków] : Academic Computer Centre CYFRONET AGH, 2009. — ISBN: 978-83-61433-00-2. — S. 58–60. — Bibliogr. s. 60, Abstr.

EPOS Thematic Core Service Anthropogenic Hazards – open-access integrated infrastructures for research and innovation in the area of anthropogenic seismicity associated with the exploitation of georesources / Lasocki S., Orlecka-Sikora B., Rudziński Ł., Lelonek M., KOCOT J., Jones G., Garcia-Aristizabal A., Bigarre P., Klein E., Blanke A., Kwiatek G., Chodzinska K., Leśnodorska A., Dineva S., Roselli P., Saccorotti G., Grasso J-R., Kozlovskaya E., Nevalainen J., Mutke G., Schaming M., Schmittbuhl J., Sileny J., STERZEL M., SZEPIENIEC T., Stimpson I. // W: 56th U. S. Rock mechanics/geomechanics symposium [Dokument elektroniczny] : June 26–29, 2022, Santa Fe, New Mexico, USA. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — [Santa Fe] : American Rock Mechanics Association, [2022]. — e-ISBN: 978-0-9794975-7-5. — S. [1–9] ARMA 22-0708. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. [8–9], Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2022-06-26. — tekst: https://onepetro-1org-10000262g00d6.wbg2.bg.agh.edu.pl/ARMAUSRMS/proceedings-pdf/ARMA22/All-ARMA22/ARMA-2022-0708/3064742/arma-2022-0708.pdf/1

Experiments in GridSpace Virtual Laboratory – principles and examples : [abstract] / Marian BUBAK, Bartosz BALIŚ, Tomasz BARTYŃSKI, Eryk CIEPIELA, Włodzimierz FUNIKA, Tomasz GUBAŁA, Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Joanna KOCOT, Maciej MALAWSKI, Jan Meizner, Piotr NOWAKOWSKI, Katarzyna RYCERZ // W: KU KDM 2011 : fourth ACC Cyfronet AGH users' conference : Zakopane, March 09–11, 2011 : proceedings. — Kraków : ACK Cyfronet AGH, [2011]. — ISBN: 978-83-61433-04-0. — S. 60–61. — Bibliogr. s. 61. — Dodatkowa afiliacja M. Bubaka: Informatics Institute, University of Amsterdam, The Netherlands

Exploratory programming in the Virtual laboratory / Eryk CIEPIELA, Daniel HARĘŻLAK, Joanna KOCOT, Tomasz BARTYŃSKI, Marek KASZTELNIK, Piotr NOWAKOWSKI, Tomasz GUBAŁA, Maciej MALAWSKI, Marian BUBAK // W: Proceedings of the International Multiconference on Computer Science and Information Technology [Dokument elektroniczny] : October 18–20, 2010, Wisła, Poland / eds. M. Ganzha, M. Paprzycki. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — Katowice : Polskie Towarzystwo Informatyczne, 2010. — Dysk Flash. — (Proceedings of the International Multiconference on Computer Science and Information Technology ; ISSN 1896-7094 ; vol. 5). — Dod. na dysku Flash: „XXVI Jesienne Spotkania”. — e-ISBN: 978-83-60810-22-4. — S. 621–628. — Wymagania systemowe: Adobe Acrobat Reader. — Bibliogr. s. 627–628, Abstr.. — Toż W: IMCSIT : proceedings of the International Multiconference on Computer Science and Information Technology : October 18–20, 2010, Wisła, Poland. Vol. 5. — Piscataway : Institute of Electrical and Rletronics Engineers, cop. 2010. — ISBN 978-83-60810-27-9. — S. 621–628. — Publikacja w ramach: 6th Workshop on Large scale computations on grids and 1st Workshop on Scalable computing in distributed systems

Exploring the population of Galactic very-high-energy $\gamma$-ray sources / Constantin Steppa, Kathrin Egberts, [et al.], T. GRABARCZYK, [et al.], J. KASPEREK, [et al.], J. KOCOT, [et al.], P. LASOŃ, [et al.], A. OZIĘBŁO, [et al.], P. RAJDA, [et al.], H. SIEJKOWSKI, [et al.], M. STERZEL, [et al.], T. SZEPIENIEC, [et al.] // PoS Proceedings of Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1824-8039. — 2022 vol. 395 art. no. 798, s. 1–18. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 4, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2022-03-18. — ICRC 2021 : 37th International Cosmic Ray Conference : 12–23 July 2021, Berlin, Germany, online. — tekst: https://pos.sissa.it/395/798/pdf

Flexible and extendable mechanism enabling secure access to e-infrastructures and storage of confidential data for the GridSpace2 virtual laboratory / Jan MEIZNER, Eryk CIEPIELA, Piotr NOWAKOWSKI, Joanna KOCOT, MAciej MALAWSKI, Marian BUBAK // W: Building a national distributed e-infrastructure – PL-Grid : scientific and technical achievements / eds. Marian Bubak, Tomasz Szepieniec, Kazimierz Wiatr. — Berlin ; Heidelberg : Springer-Verlag, cop. 2012. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 7136. Information Systems and Applications, incl. Internet/Web, and HCI). — Na okł. dod.: State-of-the-art survey ; Applications, Development and execution tools, VO and security systems, Basic services, Grid resources. — ISBN: 978-3-642-28266-9. — S. 89–101. — Bibliogr. s. 100–101, Abstr.. — Marian Bubak – dod. afiliacja: Informatics Institute, University of Amsterdam, The Netherlands

GridSpace based virtual laboratory for PL-Grid users / Maciej MALAWSKI, Eryk CIEPIELA, Joanna KOCOT, Tomasz GUBAŁA, Piotr NOWAKOWSKI, Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Tomasz BARTYŃSKI, Marian BUBAK // W: KU KDM 2010 : third ACC Cyfronet AGH users' conference : Zakopane March 18–19, 2010 : proceedings. — Kraków : ACK Cyfronet, cop. 2010. — Opis częśc. wg okł.. — ISBN: 978-83-61433-02-6. — S. 63–65. — Bibliogr. s. 65

GridSpace2 – virtual laboratory on top of PL-Grid computational resources / Tomasz BARTYŃSKI, Eryk CIEPIELA, Grzegorz DYK, Tomasz GUBAŁA, Daniel HARĘŻLAK, Tomasz JADCZYK, Marek KASZTELNIK, Joanna KOCOT, Jan MEIZNER, Maciej MALAWSKI, Piotr NOWAKOWSKI, Marian BUBAK // W: KU KDM 2012 : fifth ACC Cyfronet AGH user's conference : Zakopane, March 07–09, 2012 : proceedings / eds. Kazimierz Wiatr, Jacek Kitowski, Marian Bubak. — Kraków : ACC Cyfronet AGH, cop. 2012. — Opis częśc. wg okł.. — ISBN: 978-83-61433-05-7. — S. 73. — Afiliacja: Academic Computer Centre CYFRONET AGH

HAWC J2227+610: a potential PeVatron candidate for the CTA in the northern hemisphere / Gaia Verna, [et al.], T. GRABARCZYK, [et al.], J. KASPEREK, [et al.], J. KOCOT, [et al.], P. LASOŃ, [et al.], A. OZIĘBŁO, [et al.], P. J. RAJDA, [et al.], H. SIEJKOWSKI, [et al.], M. STERZEL, [et al.], T. SZEPIENIEC, [et al.] // PoS Proceedings of Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1824-8039. — 2022 vol. 395 art. no. 904, s. 1–19. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 8, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2022-03-18. — ICRC 2021 : 37th International Cosmic Ray Conference : 12–23 July 2021, Berlin, Germany, online. — tekst: https://pos.sissa.it/395/904/pdf

InSilicoLab: a domain-specific science gateway / Joanna KOCOT, Tomasz SZEPIENIEC, Mariusz STERZEL, Daniel HARĘŻLAK, Maciej Golik, Tomasz Twaróg, Piotr WÓjcik // W: Cracow'12 Grid Workshop : October 22–24, 2012, Krakow, Poland : proceedings / eds. Marian Bubak, Michał Turała, Kazimierz Wiatr. — Kraków : Academic Computer Centre CYFRONET AGH, 2012. — ISBN: 978-83-61433-06-4. — S. 45–46. — Bibliogr. s. 46

InSilicoLab – managing complexity of chemistry computations : [abstract] / Daniel HARĘŻLAK, Joanna KOCOT, Klemens Noga, Mariusz STERZEL, Tomasz SZEPIENIEC // W: KU KDM 2011 : fourth ACC Cyfronet AGH users' conference : Zakopane, March 09–11, 2011 : proceedings. — Kraków : ACK Cyfronet AGH, [2011]. — ISBN: 978-83-61433-04-0. — S. 84–85. — Bibliogr. s. 85

InSilicoLab – managing complexity of chemistry computations / Joanna KOCOT, Tomasz SZEPIENIEC, Daniel HARĘŻLAK, Klemens NOGA, Mariusz STERZEL // W: Building a national distributed e-infrastructure – PL-Grid : scientific and technical achievements / eds. Marian Bubak, Tomasz Szepieniec, Kazimierz Wiatr. — Berlin ; Heidelberg : Springer-Verlag, cop. 2012. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 7136. Information Systems and Applications, incl. Internet/Web, and HCI). — Na okł. dod.: State-of-the-art survey ; Applications, Development and execution tools, VO and security systems, Basic services, Grid resources. — ISBN: 978-3-642-28266-9. — S. 265–275. — Bibliogr. s. 274–275, Abstr.

InSilicoLab: the challenge of building a problem solving environment / Joanna KOCOT, Tomasz SZEPIENIEC, Daniel HARĘŻLAK, Klemens NOGA, Mariusz STERZEL // W: KU KDM 2012 : fifth ACC Cyfronet AGH user's conference : Zakopane, March 07–09, 2012 : proceedings / eds. Kazimierz Wiatr, Jacek Kitowski, Marian Bubak. — Kraków : ACC Cyfronet AGH, cop. 2012. — Opis częśc. wg okł.. — ISBN: 978-83-61433-05-7. — S. 74–75. — Bibliogr. s. 75

Managing entire lifecycles of e-science applications in the GridSpace2 virtual laboratory – from motivation through idea to operable Web-accessible environment built on top of PL-Grid e-infrastructure / Eryk CIEPIELA, Piotr NOWAKOWSKI, Joanna KOCOT, Daniel HARĘŻLAK, Tomasz GUBAŁA, Jan MEIZNER, Marek KASZTELNIK, Tomasz BARTYŃSKI, Maciej MALAWSKI, Marian BUBAK // W: Building a national distributed e-infrastructure – PL-Grid : scientific and technical achievements / eds. Marian Bubak, Tomasz Szepieniec, Kazimierz Wiatr. — Berlin ; Heidelberg : Springer-Verlag, cop. 2012. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 7136. Information Systems and Applications, incl. Internet/Web, and HCI). — Na okł. dod.: State-of-the-art survey ; Applications, Development and execution tools, VO and security systems, Basic services, Grid resources. — ISBN: 978-3-642-28266-9. — S. 228–239. — Bibliogr. s. 238–239, Abstr.. — T. Gubała, M. Bubak – dod. afiliacja: University of Amsterdam

Molecular modeling of complex systems with InSilicoLab / Joanna KOCOT, Andrzej Eilmes, Tomasz SZEPIENIEC, Mariusz STERZEL, Maciej GOLIK // W: KU KDM 2013 : sixth ACC Cyfronet AGH users' conference : Zakopane, 28 February – 1 March 2013 : proceedings / eds. Kazimierz Wiatr, Jacek Kitowski, Marian Bubak. — Kraków : ACC Cyfronet AGH, cop. 2013. — Opis częśc. wg okł.. — ISBN: 978-83-61433-07-1. — S. 45–46. — Bibliogr. s. 46

Monte Carlo simulations and validation of NectarCAM, a medium sized telescope camera for CTA / T. Armstrong, [et al.], T. GRABARCZYK, [et al.], J. KASPEREK, [et al.], J. KOCOT, [et al.], P. LASOŃ, [et al.], A. OZIĘBŁO, [et al.], P. J. RAJDA, [et al.], H. SIEJKOWSKI, [et al.], M. STERZEL, [et al.], T. SZEPIENIEC, [et al.] // PoS Proceedings of Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1824-8039. — 2022 vol. 395 art. no. 747, s. 1–14. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 8, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2022-03-18. — ICRC 2021 : 37th International Cosmic Ray Conference : 12–23 July 2021, Berlin, Germany, online. — tekst: https://pos.sissa.it/395/747/pdf