Wykaz publikacji wybranego autora

Patryk Orzechowski, dr inż.

adiunkt

Wydział Elektrotechniki, Automatyki, Informatyki i Inżynierii Biomedycznej
WEAIiIB-kair, Katedra Automatyki i Robotyki

[dyscyplina wiodąca] dziedzina nauk inżynieryjno-technicznych / informatyka techniczna i telekomunikacja

[dyscyplina dodatkowa] dziedzina nauk inżynieryjno-technicznych / inżynieria biomedyczna (25%)


[poprzednia klasyfikacja] obszar nauk technicznych / dziedzina nauk technicznych / informatyka


Identyfikatory Autora Informacje o Autorze w systemach zewnętrznych

ORCID: 0000-0003-3578-9809

ResearcherID: brak

Scopus: 55860145600

PBN: 909777

OPI Nauka Polska

System Informacyjny AGH (SkOs)


Opisy publikacji wcześniejszych zobacz: bpp.agh.edu.pl/old.



1
  • Assessment of the ergonomic of Polish major news portals based on analysis of people's behaviour while they are browsing for informationOcena ergonomii polskich portali internetowych na podstawie analizy zachowań użytkowników poszukujących zdalnych informacji / Marek ZACHARA, Cezary PISKOR-IGNATOWICZ, Lidia DUTKIEWICZ, Katarzyna GROBLER, Patryk ORZECHOWSKI, Dariusz Pałka // Automatyka = Automatics ; ISSN 1429-3447. — Tytuł poprz.: Automatyka : półrocznik Akademii Górniczo-Hutniczej im. Stanisława Staszica w Krakowie. — 2010 t. 14 z. 3/1, s. 609–617. — Bibliogr. s. 617, Streszcz., Summ.

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

2
  • A novel approach to computer aided analysis of human serum proteins chromatoelectrophoresis / Marcin Waśko, Patryk ORZECHOWSKI, Norbert Wnuk, Marcin Krzych // Journal of Medical Informatics & Technologies / Uniwersytet Śląski. Instytut Informatyki. Zakład Systemów Komputerowych, Katowice ; ISSN 1642-6037. — Tytuł poprz.: Medical Informatics & Technologies. — 2008 vol. 12, s. 129–135. — Bibliogr. s. 134–135

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

3
4
  • Considerations for automated machine learning in clinical metabolic profiling: Altered homocysteine plasma concentration associated with metformin exposure / Alena Orlenko, Jason H. Moore, Patryk ORZECHOWSKI, Randal S. Olson, Junmei Cairns, Pedro J. Caraballo, Richard M. Weinshilboum, Liewei Wang, Matthew K. Breitenstein // W: Pacific Symposium on Biocomputing 2018 [Dokument elektroniczny] : 3–7 January 2018, Kohala Coast, USA / eds. Russ B. Altman, [et al.]. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — Singapore : World Scientific Publishing Co. Pte. Ltd., [2018]. — (Pacific symposium on biocomputing...(Online) ; ISSN 2335-6936). — e-ISBN: 978-981-3235-53-3. — S. 460–471. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 471. — Patryk Orzechowski – dod. afiliacja: University of Pennsylvania. — tekst: https://www.worldscientific.com/doi/pdf/10.1142/9789813235533_0042

  • keywords: metabolomics, homocysteine, clinical metabolic profiling, automated machine learning, confounding, pharmacometabolomics, biobank, precision medicine, metformin

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1142/9789813235533_0042

5
  • EBIC: an evolutionary-based parallel biclustering algorithm for pattern discovery / Patryk ORZECHOWSKI, Moshe Sipper, Xiuzhen Huang, Jason H. Moore // Bioinformatics ; ISSN 1367-4803. — 2018 vol. 34 iss. 21, s. 3719–3726. — Bibliogr. s. 3726, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2018-05-22. — P. Orzechowski - pierwsza afiliacja: University of Pennsylvania, USA

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1093/bioinformatics/bty401

6
  • EBIC: an open source software for high-dimensional and big data analyses / Patryk ORZECHOWSKI, Jason H. Moore // Bioinformatics ; ISSN 1367-4803. — 2019 vol. 35 iss. 17, s. 3181–3183. — Bibliogr. s. 3183, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2019-01-14. — P. Orzechowski – dod. afiliacja: University of Pennsylvania, United States

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1093/bioinformatics/btz027

7
  • EBIC: a scalable biclustering method for large scale data analysis / Patryk ORZECHOWSKI, Jason H. Moore // W: GECCO 2019 [Dokument elektroniczny] : the Genetic and Evolutionary Computation Conference : a recombination of the 28th International Conference on Genetic Algorithms (ICGA) and the 24rd Annual Genetic Programming Conference (GP) : July 13th–17th 2019, Prague, Czech Republic. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — USA : ACM, cop. 2019. — e-ISBN: 978-1-4503-6748-6. — S. 31–32. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Tryb dostępu: https://dl.acm.org/ft_gateway.cfm?id=3326762&ftid=2071089&dwn=1&CFID=159232094&CFTOKEN=31a5d05962667e84-AB0E577E-F6FB-4DE0-0CE2E4AC5C75B130 [2019-09-18]. — Bibliogr. s. 32, Abstr.. — P. Orzechowski – dod. afiliacja: University of Pennsylvania

  • keywords: evolutionary computation, biclustering, data mining, genetic programming, unsupervised machine learning

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1145/3319619.3326762

8
  • Effective biclustering on GPU - capabilities and constraintsEfektywna biklasteryzacja z wykorzystaniem GPU - możliwości i ograniczenia / Patryk ORZECHOWSKI, Krzysztof BORYCZKO // Przegląd Elektrotechniczny / Stowarzyszenie Elektryków Polskich ; ISSN 0033-2097. — 2015 R. 91 nr 8, s. 131–134. — Bibliogr. s. 134, Abstr., Streszcz.. — tekst: http://pe.org.pl/articles/2015/8/31.pdf

  • słowa kluczowe: klasyfikacja, rozpoznawanie wzorców, GPU, biklasteryzacja, CUDA, OpenCL, programowanie równoległe

    keywords: pattern recognition, OpenCL, biclustering, data mining, GPU, CUDA, parallel programming

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.15199/48.2015.08.31

9
  • Hybrid biclustering algorithms [Dokument elektroniczny] / Patryk ORZECHOWSKI. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — Kraków : AGH University of Science and Technology Press, 2016. — 1 dysk optyczny. — XII, 163 s.. — (Rozprawy Doktorskie. Monografie / Akademia Górniczo-Hutnicza). — Wymagania systemowe: Adobe Reader ; napęd CD-ROM. — Bibliogr. s. 126–143. — e-ISBN: 978-83-7464-891

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

10
  • Hybrid biclustering algorithms for data mining / Patryk ORZECHOWSKI, Krzysztof BORYCZKO // W: Applications of evolutionary computation : 19th European Conference, EvoApplications 2016 : Porto, Portugal, March 30– April 1, 2016 : proceedings, Pt. 1 / eds. Giovanni Squillero, Paolo Burelli. — Switzerland : Springer International Publishing, 2016. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 9597). — ISBN: 978-3-319-31203-3 ; e-ISBN: 978-3-319-31204-0. — S. 156–168. — Bibliogr. s. 166–168, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2016-03-15

  • keywords: data mining, microarray analysis, gene expression data, biclustering techniques

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1007/978-3-319-31204-0_11

11
  • Mapping patient trajectories using longitudinal extraction and deep learning in the MIMIC-III critical care database / Brett K. Beaulieu-Jones, Patryk ORZECHOWSKI, Jason H. Moore // W: Pacific Symposium on Biocomputing 2018 [Dokument elektroniczny] : 3–7 January 2018, Kohala Coast, USA / eds. Russ B. Altman, [et al.]. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — Singapore : World Scientific Publishing Co. Pte. Ltd., [2018]. — (Pacific symposium on biocomputing...(Online) ; ISSN 2335-6936). — e-ISBN: 978-981-3235-53-3. — S. 123–132. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 131–132. — Patryk Orzechowski – dod. afiliacja: Perelman School of Medicine. — tekst: https://www.worldscientific.com/doi/pdf/10.1142/9789813235533_0012

  • keywords: deep learning, electronic health records, patient trajectories, longitudinal, unsupervised, autoencoders, long short term memory networks

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1142/9789813235533_0012

12
  • Metoda deterioracji funkcji celu dla algorytmów poszukiwań ewolucyjnych z miękką selekcjąMethod of fitness function deterioration for evolutionary algorithms with soft selection / Patryk ORZECHOWSKI // Automatyka = Automatics ; ISSN 1429-3447. — Tytuł poprz.: Automatyka : półrocznik Akademii Górniczo-Hutniczej im. Stanisława Staszica w Krakowie. — 2009 t. 13 z. 3 [cz.] 1, s. 1171–1179. — Bibliogr. s. 1178–1179, Streszcz., Summ.. — tekst: http://journals.bg.agh.edu.pl/AUTOMATYKA/2009-03/Auto39.pdf

  • słowa kluczowe: algorytmy ewolucyjne, miękka selekcja, funkcja Gaussa

    keywords: evolutionary algorithms, Gauss function, soft selection

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

13
  • Metoda wyodrębniania frakcji na podstawie analizy obrazu białek osocza ludzkiej krwiMethod of fraction differentiation basing on image analysis of human serum proteins / Patryk ORZECHOWSKI, Marcin Waśko // Automatyka = Automatics ; ISSN 1429-3447. — Tytuł poprz.: Automatyka : półrocznik Akademii Górniczo-Hutniczej im. Stanisława Staszica w Krakowie. — 2008 t. 12 z. 3, s. 709–722. — Bibliogr. s. 720–722, Streszcz., Summ.. — tekst: http://journals.bg.agh.edu.pl/AUTOMATYKA/2008-03/Auto12.pdf

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

14
  • Mining a massive RNA-seq dataset with biclustering: are evolutionary approaches ready for big data? / Patryk ORZECHOWSKI, Jason H. Moore // W: GECCO 2019 [Dokument elektroniczny] : the Genetic and Evolutionary Computation Conference : a recombination of the 28th International Conference on Genetic Algorithms (ICGA) and the 24rd Annual Genetic Programming Conference (GP) : July 13th–17th 2019, Prague, Czech Republic. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — USA : ACM, cop. 2019. — e-ISBN: 978-1-4503-6748-6. — S. 304–305. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Tryb dostępu: https://dl.acm.org/ft_gateway.cfm?id=3321916&ftid=2071065&dwn=1&CFID=159222870&CFTOKEN=17d434429a76e8de-A9BAA9D5-9D0C-E8B3-ADB384BB42F57014 [2019-09-18]. — Bibliogr. s. 305, Abstr.. — P. Orzechowski – dod. afilicja: University of Pennsylvania

  • keywords: evolutionary computation, big data, biclustering, data mining

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1145/3319619.3321916

15
  • Parallel approach for visual clustering of protein databases / Patryk ORZECHOWSKI, Krzysztof BORYCZKO // Computing and Informatics / Slovak Academy of Sciences. Institute of Informatics ; ISSN 1335-9150. — Tytuł poprz.: Computers and Artificial Intelligence. — 2010 vol. 29, s. 1221–1231. — Bibliogr. s. 1229–1231, Abstr.

  • keywords: clustering algorithms, proteins, sequence alignment, ltidimensional scaling

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

16
  • PMLB: a large benchmark suite for machine learning evaluation and comparison / Randal S. Olson, William La Cava, Patryk ORZECHOWSKI, Ryan J. Urbanowicz, Jason H. Moore // BioData Mining [Dokument elektroniczny]. - Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1756-0381. — 2017 vol. 10 iss. 1 art. no. 36, s. 1–13. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 12–13, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2017-12-11. — P. Orzechowski – dod. afiliacja: University of Pennsylvania. — tekst: https://biodatamining.biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/s13040-017-0154-4

  • keywords: machine learning, benchmarking, model evaluation, data repository

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1186/s13040-017-0154-4

17
  • Problematyka modelowania ruchu miejskiego z wykorzystaniem automatów komórkowychIssues of city traffic modeling based on cellular automata / Jarosław WĄS, Rafał Bieliński, Bartłomiej Gajewski, Patryk ORZECHOWSKI // Automatyka = Automatics ; ISSN 1429-3447. — Tytuł poprz.: Automatyka : półrocznik Akademii Górniczo-Hutniczej im. Stanisława Staszica w Krakowie. — 2009 t. 13 z. 3 [cz.] 1, s. 1207–1217. — Bibliogr. s. 1217, Streszcz., Summ.

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

18
  • Propagation-based biclustering algorithm for extracting inclusion-maximal motifs / Patryk ORZECHOWSKI, Krzysztof BORYCZKO // Computing and Informatics / Slovak Academy of Sciences. Institute of Informatics ; ISSN 1335-9150. — Tytuł poprz.: Computers and Artificial Intelligence. — 2016 vol. 35 no. 2, s. 391–410. — Bibliogr. s. 408–410, Abstr.

  • keywords: biclustering, microarray gene expression data, data mining, bioinformatics, pattern matching, conserved gene expression motifs

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

19
  • Proximity measures and results validation in biclustering – a survey / Patryk ORZECHOWSKI // W: Artificial Intelligence and Soft Computing : 12th International Conference, ICAISC 2013 : Zakopane, Poland, June 9–13, 2013 : proceedings, Pt. 2 / eds. Leszek Rutkowski [et al.]. — Berlin ; Heidelberg : Springer-Verlag, cop. 2013. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; 7895. Lecture Notes in Artificial Intelligence). — ISBN: 978-3-642-38609-1 ; e-ISBN: 978-3-642-38610-7. — S. 206–217. — Bibliogr. S. 214–217, Abstr.

  • keywords: biclustering, co-clustering, shifting and scaling patterns, pattern similarity, proximity measures, results validation, microarray gene expression data, state-of-the-art, survey

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1007/978-3-642-38610-7_20

20
  • QtBiVis: a software toolbox for visual analysis of biclustering experiment / Artur Pańszczyk, Patryk ORZECHOWSKI // W: FedCSIS : abstracts of the Federated Conference on Computer Science and Information Systems : 11–14 September, 2016, Gdansk, Poland : book of abstracts. — [Poland : s. n.], [2016]. — ISBN: 978-836081090-3. — S. 105. — Pełny tekst W: FedCSiS 2016 [Dokument elektroniczny] : preproceedings of the 2016 Federated Conference on Computer Science and Information Systems : September 11–14, 2016, Gdańsk, Poland / eds. Maria Ganzha, Leszek Maciaszek, Marcin Paprzycki. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — Warsaw : Polskie Towarzystwo Informatyczne, cop. 2016. — (Annals of Computer Science and Information Systems ; ISSN 2300-5963 ; vol. 8). — ISBN 978-83-60810-90-3. — S. 1375–1378. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Tryb dostępu: {https://fedcsis.org/proceedings/2016/pliks/129.pdf} [2016-10-04]. — Bibliogr. s. 1378, Abstr.. — Afiliacja Autorów zamieszczona przy pełnym tekście

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.15439/2016F129

21
  • Retrieving impressions from semantic memory modeled with associative pulsing neural networks / Patryk ORZECHOWSKI, Adrian HORZYK, Janusz A. Starzyk, Jason H. Moore // W: IEEE SSCI 2018 [Dokument elektroniczny] : proceedings of the 2018 IEEE Symposium Series on Computational Intelligence : 18–21 November 2018, Bengaluru, India / ed. Suresh Sundaram. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — [Piscataway] : IEEE, cop. 2018. — 1 dysk Flash. — Dod. ISBN 978-1-5386-9276-9. — e-ISBN: 978-1-5386-9275-2. — S. 2060–2067. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 2067, Abstr.. — P. Orzechowski - pierwsza afiliacja: University of Pennsylvania, USA

  • keywords: text mining, natural language processing, information retrieval, topic modeling, spiking neurons, bag of words

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1109/SSCI.2018.8628780

22
  • Rough assessment of GPU capabilities for parallel PCC-based biclustering method applied to microarray data sets / Patryk ORZECHOWSKI, Krzysztof BORYCZKO // Bio-Algorithms and Med-Systems (Print) / Jagiellonian University. Medical College ; ISSN 1895-9091. — 2015 vol. 11 iss. 4, s. 243–248. — Bibliogr. s. 247–248, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2015-12-02

  • keywords: OpenCL, biclustering, data mining, parallel algorithms, graphics processing unit (GPU)

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1515/bams-2015-0033

23
  • runibic: a bioconductor package for parallel row-based biclustering of gene expression data / Patryk ORZECHOWSKI, Artur PAŃSZCZYK, Xiuzhen Huang, Jason H. Moore // Bioinformatics ; ISSN 1367-4803. — 2018 vol. 34 iss. 24, s. 4302–4304. — Bibliogr. s. 4304, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2018-06-23. — P. Orzechowski – dod. afiliacja: University of Pennsylvania

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1093/bioinformatics/bty512

24
  • Scalable biclustering – the future of big data exploration? / Patryk ORZECHOWSKI, Krzysztof BORYCZKO, Jason H. Moore // GigaScience [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 2047-217X. — 2019 vol. 8 iss. 7 art. no. giz078, s. 1–4. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 4, Abstr.. — P. Orzechowski – dod. afiliacja: University of Pennsylvania. — tekst: https://academic.oup.com/gigascience/article-pdf/8/7/giz078/28880874/giz078.pdf

  • keywords: big data, biclustering, co-clustering, data mining, parallel algorithms, precision medicine, disease subtype identification, biomarker detection, gene-drug interaction

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1093/gigascience/giz078

25
  • Strategies for improving performance of evolutionary biclustering algorithm EBIC / Patryk ORZECHOWSKI, Jason H. Moore // W: GECCO 2019 [Dokument elektroniczny] : the Genetic and Evolutionary Computation Conference : a recombination of the 28th International Conference on Genetic Algorithms (ICGA) and the 24rd Annual Genetic Programming Conference (GP) : July 13th–17th 2019, Prague, Czech Republic. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — USA : ACM, cop. 2019. — e-ISBN: 978-1-4503-6748-6. — S. 185–186. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Tryb dostępu: https://dl.acm.org/ft_gateway.cfm?id=3322046&ftid=2070965&dwn=1&CFID=159230098&CFTOKEN=dbf964c3ffd6b638-AABADDC5-D174-109B-686E8A02C17FE15E [2019-09-18]. — Bibliogr. s. 186, Abstr.. — P. Orzechowski – dod. afiliacja: University of Pennsylvania

  • keywords: evolutionary computation, machine learning, biclustering, data mining

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1145/3319619.3322046