Wykaz publikacji wybranego autora

Patryk Orzechowski, dr inż.

adiunkt

Wydział Elektrotechniki, Automatyki, Informatyki i Inżynierii Biomedycznej
WEAIiIB-kair, Katedra Automatyki i Robotyki


  • 2018

    [dyscyplina 1] dziedzina nauk inżynieryjno-technicznych / informatyka techniczna i telekomunikacja

    [dyscyplina 2] dziedzina nauk inżynieryjno-technicznych / inżynieria biomedyczna (25%)


[poprzednia klasyfikacja] obszar nauk technicznych / dziedzina nauk technicznych / informatyka


Identyfikatory Autora Informacje o Autorze w systemach zewnętrznych

ORCID: 0000-0003-3578-9809 orcid iD

ResearcherID: brak

Scopus: 55860145600

PBN: 5e70922c878c28a0473911ac

OPI Nauka Polska

System Informacyjny AGH (SkOs)




1
  • A comparative study of GP-based and state-of-the-art classifiers on a synthetic machine learning benchmark / Patryk ORZECHOWSKI, Paweł RENC, William La Cava, Jason H. Moore, Arkadiusz Sitek, Jarosław WĄS, Joost Wagenaar // W: GECCO'22 companion [Dokument elektroniczny] : proceedings of the 2022 Genetic and Evolutionary Computation Conference Companion : July 9–13, 2022, Boston, Massachusetts, [USA], [vol. 1]. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — New York : The Association for Computing Machinery, cop. 2022. — e-ISBN: 987-1-4503-9268-6. — S. 276–279. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 279, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2022-07-19. — P. Orzechowski - dod. afiliacja: University of Pennsylvania, USA ; P. Renc - dod. afiliacja: Sano, Centre for Computational Medicine, Kraków. — tekst: https://dl-1acm-1org-100000dpq0020.wbg2.bg.agh.edu.pl/doi/pdf/10.1145/3520304.3529056

    orcid iD
  • keywords: machine learning, evolutionary algorithms, benchmarking, classification, genetic programming

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1145/3520304.3529056

2
  • A novel approach to computer aided analysis of human serum proteins chromatoelectrophoresis / Marcin Waśko, Patryk ORZECHOWSKI, Norbert Wnuk, Marcin Krzych // Journal of Medical Informatics & Technologies / Uniwersytet Śląski. Instytut Informatyki. Zakład Systemów Komputerowych, Katowice ; ISSN 1642-6037. — Tytuł poprz.: Medical Informatics & Technologies. — 2008 vol. 12, s. 129–135. — Bibliogr. s. 134–135

  • słowa kluczowe: przetwarzanie obrazu, elektroforeza chromatografia, białka surowicy, przełom algorytmów

    keywords: image processing, chromatoelectrophoresis, serum proteins, watershed algorithms

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

3
  • Artificial intelligence for COVID-19 detection in medical imaging – diagnostic measures and wasting – a systematic umbrella review / Paweł JEMIOŁO, Dawid Storman, Patryk ORZECHOWSKI // Journal of Clinical Medicine [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 2077-0383. — 2022 vol. 11 iss. 7 art. no. 2054, s. 1–16. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 12–16, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2022-04-06. — P. Orzechowski - dod. afiliacja: University of Pennsylvania, Philadelphia, USA. — tekst: https://www.mdpi.com/2077-0383/11/7/2054/pdf

    orcid iD
  • keywords: artificial intelligence, diagnosis, medical imaging, COVID-19, methodological credibility, systematic umbrella review

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.3390/jcm11072054

4
  • Assessment of the ergonomic of Polish major news portals based on analysis of people's behaviour while they are browsing for informationOcena ergonomii polskich portali internetowych na podstawie analizy zachowań użytkowników poszukujących zdalnych informacji / Marek ZACHARA, Cezary PISKOR-IGNATOWICZ, Lidia DUTKIEWICZ, Katarzyna GROBLER, Patryk ORZECHOWSKI, Dariusz Pałka // Automatyka : półrocznik Akademii Górniczo-Hutniczej im. Stanisława Staszica w Krakowie ; ISSN 1429-3447. — 2010 t. 14 z. 3/1, s. 609–617. — Bibliogr. s. 617, Streszcz., Summ.. — tekst: https://journals.bg.agh.edu.pl/AUTOMATYKA/2010-03-1/Auto32.pdf

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

5
  • Automated affect and emotion recognition from cardiovascular signals – a systematic overview of the field / Paweł JEMIOŁO, Dawid Storman, Maria Mamica, Mateusz Szymkowski, Patryk ORZECHOWSKI // W: HICSS 2022 [Dokument elektroniczny] : 55th Hawaii International Conference on System Sciences 2022 : human-centricity in a sustainable digital economy : [Jan 4–7, 2022, Hawaii, USA]. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — [Honolulu : University of Hawaii at Manoa], [2022]. — e-ISBN: 978-0-9981331-5-7. — S. 4047–4056. — Bibliogr. s. 4054–4056, Abstr.. — P. Orzechowski - pierwsza afiliacja: University of Pennsylvannia, Philadelphia, USA. — tekst: https://scholarspace.manoa.hawaii.edu/bitstream/10125/79830/1/0399.pdf

    orcid iD
  • keywords: assisted living, wellness management, systematic review, health monitioring, automated affect and emotion recognition

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

6
  • Benchmarking manifold learning methods on a large collection of datasets / Patryk ORZECHOWSKI, Franciszek Magiera, Jason H. Moore // W: Genetic Programming : 23rd European conference, EuroGP2020 : held as part of EvoStar 2020 : Seville, Spain, April 15–17, 2020 : proceedings / eds. Ting Hu, [et al.]. — Cham : Springer Nature Switzerland, cop. 2020. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; 12101. Theoretical Computer Science and General Issues ; ISSN 2512-2010). — ISBN: 978-3-030-44093-0 ; e-ISBN: 978-3-030-44094-7. — S. 135–150. — Bibliogr. s. 148–150, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2020-04-09. — P. Orzechowski - pierwsza afiliacja: University of Pennsylvania, Philadelphia, USA

    orcid iD
  • keywords: machine learning, benchmarking, genetic programming, dimensionality reduction, manifold learning

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1007/978-3-030-44094-7_9

7
  • Considerations for automated machine learning in clinical metabolic profiling: Altered homocysteine plasma concentration associated with metformin exposure / Alena Orlenko, Jason H. Moore, Patryk ORZECHOWSKI, Randal S. Olson, Junmei Cairns, Pedro J. Caraballo, Richard M. Weinshilboum, Liewei Wang, Matthew K. Breitenstein // W: Pacific Symposium on Biocomputing 2018 [Dokument elektroniczny] : 3–7 January 2018, Kohala Coast, USA / eds. Russ B. Altman, [et al.]. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — Singapore : World Scientific Publishing Co. Pte. Ltd., [2018]. — (Pacific symposium on biocomputing...(Online) ; ISSN 2335-6936). — e-ISBN: 978-981-3235-53-3. — S. 460–471. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 471. — Patryk Orzechowski – dod. afiliacja: University of Pennsylvania. — tekst: https://www.worldscientific.com/doi/pdf/10.1142/9789813235533_0042

    orcid iD
  • keywords: metabolomics, homocysteine, clinical metabolic profiling, automated machine learning, confounding, pharmacometabolomics, biobank, precision medicine, metformin

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1142/9789813235533_0042

8
  • EBIC: a scalable biclustering method for large scale data analysis / Patryk ORZECHOWSKI, Jason H. Moore // W: GECCO 2019 [Dokument elektroniczny] : the Genetic and Evolutionary Computation Conference : a recombination of the 28th International Conference on Genetic Algorithms (ICGA) and the 24rd Annual Genetic Programming Conference (GP) : July 13th–17th 2019, Prague, Czech Republic. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — USA : ACM, cop. 2019. — e-ISBN: 978-1-4503-6748-6. — S. 31–32. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Tryb dostępu: https://dl.acm.org/ft_gateway.cfm?id=3326762&ftid=2071089&dwn=1&CFID=159232094&CFTOKEN=31a5d05962667e84-AB0E577E-F6FB-4DE0-0CE2E4AC5C75B130 [2019-09-18]. — Bibliogr. s. 32, Abstr.. — P. Orzechowski – dod. afiliacja: University of Pennsylvania

    orcid iD
  • keywords: evolutionary computation, biclustering, data mining, genetic programming, unsupervised machine learning

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1145/3319619.3326762

9
  • EBIC: an evolutionary-based parallel biclustering algorithm for pattern discovery / Patryk ORZECHOWSKI, Moshe Sipper, Xiuzhen Huang, Jason H. Moore // Bioinformatics ; ISSN 1367-4803. — 2018 vol. 34 iss. 21, s. 3719–3726. — Bibliogr. s. 3726, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2018-05-22. — P. Orzechowski - pierwsza afiliacja: University of Pennsylvania, USA

    orcid iD
  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1093/bioinformatics/bty401

10
  • EBIC: an open source software for high-dimensional and big data analyses / Patryk ORZECHOWSKI, Jason H. Moore // Bioinformatics ; ISSN 1367-4803. — 2019 vol. 35 iss. 17, s. 3181–3183. — Bibliogr. s. 3183, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2019-01-14. — P. Orzechowski – dod. afiliacja: University of Pennsylvania, United States

    orcid iD
  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1093/bioinformatics/btz027

11
  • EBIC.JL - an efficient implementation of evolutionary biclustering algorithm in Julia / Paweł Renc, Patryk ORZECHOWSKI, Aleksander BYRSKI, Jarosław WĄS, Jason H. Moore // W: GECCO'21 [Dokument elektroniczny] : Genetic and Evolutionary Computation Conference Companion : July 10-14, 2021, Lille, France : proceedings. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — USA : Association for Computing Machinery, cop. 2021. — e-ISBN: 987-1-4503-8351-6. — S. 1540–1548. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Tryb dostępu: https://dl.acm.org/doi/pdf/10.1145/3449726.3463197 [2021-07-22]. — Bibliogr. s. 1547–1548, Abstr.. — P. Orzechowski - dod. afiliacja: University of Pennsylvania, Philadelphia, USA

    orcid iD
  • keywords: evolutionary computation, machine learning, biclustering, data mining, parallel algorithms

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1145/3449726.3463197

12
  • Effective biclustering on GPU - capabilities and constraintsEfektywna biklasteryzacja z wykorzystaniem GPU - możliwości i ograniczenia / Patryk ORZECHOWSKI, Krzysztof BORYCZKO // Przegląd Elektrotechniczny / Stowarzyszenie Elektryków Polskich ; ISSN 0033-2097. — 2015 R. 91 nr 8, s. 131–134. — Bibliogr. s. 134, Abstr., Streszcz.. — tekst: http://pe.org.pl/articles/2015/8/31.pdf

  • słowa kluczowe: klasyfikacja, rozpoznawanie wzorców, GPU, biklasteryzacja, CUDA, OpenCL, programowanie równoległe

    keywords: pattern recognition, OpenCL, biclustering, data mining, GPU, CUDA, parallel programming

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.15199/48.2015.08.31

13
  • Hybrid biclustering algorithms [Dokument elektroniczny] / Patryk ORZECHOWSKI. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — Kraków : AGH University of Science and Technology Press, 2016. — 1 dysk optyczny. — XII, 163 s.. — (Rozprawy Doktorskie. Monografie / Akademia Górniczo-Hutnicza). — Wymagania systemowe: Adobe Reader ; napęd CD-ROM. — Bibliogr. s. 126–143. — e-ISBN: 978-83-7464-891

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

14
  • Hybrid biclustering algorithms for data mining / Patryk ORZECHOWSKI, Krzysztof BORYCZKO // W: Applications of evolutionary computation : 19th European Conference, EvoApplications 2016 : Porto, Portugal, March 30–April 1, 2016 : proceedings, Pt. 1 / eds. Giovanni Squillero, Paolo Burelli. — Switzerland : Springer International Publishing, 2016. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 9597). — ISBN: 978-3-319-31203-3 ; e-ISBN: 978-3-319-31204-0. — S. 156–168. — Bibliogr. s. 166–168, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2016-03-15

  • keywords: data mining, microarray analysis, gene expression data, biclustering techniques

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1007/978-3-319-31204-0_11

15
  • Mapping patient trajectories using longitudinal extraction and deep learning in the MIMIC-III critical care database / Brett K. Beaulieu-Jones, Patryk ORZECHOWSKI, Jason H. Moore // W: Pacific Symposium on Biocomputing 2018 [Dokument elektroniczny] : 3–7 January 2018, Kohala Coast, USA / eds. Russ B. Altman, [et al.]. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — Singapore : World Scientific Publishing Co. Pte. Ltd., [2018]. — (Pacific symposium on biocomputing...(Online) ; ISSN 2335-6936). — e-ISBN: 978-981-3235-53-3. — S. 123–132. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 131–132. — Patryk Orzechowski – dod. afiliacja: Perelman School of Medicine. — tekst: https://www.worldscientific.com/doi/pdf/10.1142/9789813235533_0012

  • keywords: deep learning, electronic health records, patient trajectories, longitudinal, unsupervised, autoencoders, long short-term memory networks

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1142/9789813235533_0012

16
  • Mining a massive RNA-seq dataset with biclustering: are evolutionary approaches ready for big data? / Patryk ORZECHOWSKI, Jason H. Moore // W: GECCO 2019 [Dokument elektroniczny] : the Genetic and Evolutionary Computation Conference : a recombination of the 28th International Conference on Genetic Algorithms (ICGA) and the 24rd Annual Genetic Programming Conference (GP) : July 13th–17th 2019, Prague, Czech Republic. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — USA : ACM, cop. 2019. — e-ISBN: 978-1-4503-6748-6. — S. 304–305. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Tryb dostępu: https://dl.acm.org/ft_gateway.cfm?id=3321916&ftid=2071065&dwn=1&CFID=159222870&CFTOKEN=17d434429a76e8de-A9BAA9D5-9D0C-E8B3-ADB384BB42F57014 [2019-09-18]. — Bibliogr. s. 305, Abstr.. — P. Orzechowski – dod. afilicja: University of Pennsylvania

    orcid iD
  • keywords: evolutionary computation, big data, biclustering, data mining

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1145/3319619.3321916

17
  • Parallel approach for visual clustering of protein databases / Patryk ORZECHOWSKI, Krzysztof BORYCZKO // Computing and Informatics / Slovak Academy of Sciences. Institute of Informatics ; ISSN 1335-9150. — Tytuł poprz.: Computers and Artificial Intelligence. — 2010 vol. 29, s. 1221–1231. — Bibliogr. s. 1229–1231, Abstr.

  • keywords: clustering algorithms, proteins, sequence alignment, ltidimensional scaling

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

18
  • Parallel approach for visualizing protein databases / Patryk ORZECHOWSKI, Krzysztof BORYCZKO // W: KU KDM 2009 : druga konferencja użytkowników komputerów dużej mocy : Zakopane, March 12–13, 2009 : abstracts / ACK Cyfronet AGH. — Kraków : ACK Cyfronet AGH, 2009. — Opis częśc. wg okł.. — S. 31–34. — Bibliogr. s. 33–34

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

19
  • Personalized medicine / Patryk ORZECHOWSKI, Michael Stauffer, Jason H. Moore, Mary Regina Boland // W: Simulations in medicine : computer-aided diagnostics and therapy / ed. Irena Roterman-Konieczna. — Berlin ; Boston : Walter de Gruyter GmbH, cop. 2020. — Dod. e-ISBN (EPUB) 978-3-11-067691-4. — ISBN: 978-3-11-066687-8 ; e-ISBN: 978-3-11-066721-9. — S. 1–14. — Bibliogr. s. 12–14. — P. Orzechowski - dod. afiliacja: University of Pennsylvania. — tekst: https://www.degruyter.com/downloadpdf/title/561095

    orcid iD
  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1515/9783110667219-001

20
  • PMLB: a large benchmark suite for machine learning evaluation and comparison / Randal S. Olson, William La Cava, Patryk ORZECHOWSKI, Ryan J. Urbanowicz, Jason H. Moore // BioData Mining [Dokument elektroniczny]. - Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1756-0381. — 2017 vol. 10 iss. 1 art. no. 36, s. 1–13. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 12–13, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2017-12-11. — P. Orzechowski – dod. afiliacja: University of Pennsylvania. — tekst: https://biodatamining.biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/s13040-017-0154-4

    orcid iD
  • keywords: machine learning, benchmarking, model evaluation, data repository

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1186/s13040-017-0154-4

21
  • Propagation-based biclustering algorithm for extracting inclusion-maximal motifs / Patryk ORZECHOWSKI, Krzysztof BORYCZKO // Computing and Informatics / Slovak Academy of Sciences. Institute of Informatics ; ISSN 1335-9150. — Tytuł poprz.: Computers and Artificial Intelligence. — 2016 vol. 35 no. 2, s. 391–410. — Bibliogr. s. 408–410, Abstr.

  • keywords: biclustering, microarray gene expression data, data mining, bioinformatics, pattern matching, conserved gene expression motifs

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

22
  • Proximity measures and results validation in biclustering – a survey / Patryk ORZECHOWSKI // W: Artificial Intelligence and Soft Computing : 12th International Conference, ICAISC 2013 : Zakopane, Poland, June 9–13, 2013 : proceedings, Pt. 2 / eds. Leszek Rutkowski [et al.]. — Berlin ; Heidelberg : Springer-Verlag, cop. 2013. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; 7895. Lecture Notes in Artificial Intelligence). — ISBN: 978-3-642-38609-1 ; e-ISBN: 978-3-642-38610-7. — S. 206–217. — Bibliogr. S. 214–217, Abstr.

  • keywords: biclustering, co-clustering, shifting and scaling patterns, pattern similarity, proximity measures, results validation, microarray gene expression data, state-of-the-art, survey

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1007/978-3-642-38610-7_20

23
  • QtBiVis: a software toolbox for visual analysis of biclustering experiment / Artur Pańszczyk, Patryk ORZECHOWSKI // W: FedCSIS : abstracts of the Federated Conference on Computer Science and Information Systems : 11–14 September, 2016, Gdansk, Poland : book of abstracts. — [Poland : s. n.], [2016]. — ISBN: 978-836081090-3. — S. 105. — Pełny tekst W: FedCSiS 2016 [Dokument elektroniczny] : preproceedings of the 2016 Federated Conference on Computer Science and Information Systems : September 11–14, 2016, Gdańsk, Poland / eds. Maria Ganzha, Leszek Maciaszek, Marcin Paprzycki. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — Warsaw : Polskie Towarzystwo Informatyczne, cop. 2016. — (Annals of Computer Science and Information Systems ; ISSN 2300-5963 ; vol. 8). — ISBN 978-83-60810-90-3. — S. 1375–1378. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Tryb dostępu: {https://fedcsis.org/proceedings/2016/pliks/129.pdf} [2016-10-04]. — Bibliogr. s. 1378, Abstr.. — Afiliacja Autorów zamieszczona przy pełnym tekście

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.15439/2016F129

24
  • Rapid prototyping of evolution-driven biclustering methods in Julia / Paweł Renc, Patryk ORZECHOWSKI, Aleksander BYRSKI, Jarosław WĄS, Jason H. Moore // W: GECCO'21 [Dokument elektroniczny] : Genetic and Evolutionary Computation Conference Companion : July 10-14, 2021, Lille, France : proceedings. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — USA : Association for Computing Machinery, cop. 2021. — e-ISBN: 987-1-4503-8351-6. — S. 61–62. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Tryb dostępu: https://dl.acm.org/doi/pdf/10.1145/3449726.3462739 [2021-07-22]. — Bibliogr. s. 62, Abstr.. — P. Orzechowski - dod. afiliacja: University of Pennsylvania, Philadelphia, USA

    orcid iD
  • keywords: evolutionary computation, machine learning, biclustering, data mining, parallel algorithms

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1145/3449726.3462739

25
  • Retrieving impressions from semantic memory modeled with associative pulsing neural networks / Patryk ORZECHOWSKI, Adrian HORZYK, Janusz A. Starzyk, Jason H. Moore // W: IEEE SSCI 2018 [Dokument elektroniczny] : proceedings of the 2018 IEEE Symposium Series on Computational Intelligence : 18–21 November 2018, Bengaluru, India / ed. Suresh Sundaram. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — [Piscataway] : IEEE, cop. 2018. — 1 dysk Flash. — Dod. ISBN 978-1-5386-9276-9. — e-ISBN: 978-1-5386-9275-2. — S. 2060–2067. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 2067, Abstr.. — P. Orzechowski - pierwsza afiliacja: University of Pennsylvania, USA

    orcid iD
  • keywords: text mining, natural language processing, information retrieval, topic modeling, spiking neurons, bag of words

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1109/SSCI.2018.8628780