Wykaz publikacji wybranego autora

Marek Kasztelnik, mgr

pracownik naukowo-techniczny

Akademickie Centrum Komputerowe ,,Cyfronet'' AGH
ACK-zwe, Zespół Współpracy Europejskiej

Identyfikatory Autora Informacje o Autorze w systemach zewnętrznych

ORCID: 0000-0002-8473-5236 połącz konto z ORCID

ResearcherID: FFL-5159-2022

Scopus: 24474623200

System Informacyjny AGH (SkOs)

1
2

  • A lightweight method of metadata and data management with DataNet / Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Maciej PAWLIK,Bartosz WILK, Marian BUBAK // W: eScience on distributed computing infrastructure : achievements of PLGrid Plus domain-specific services and tools / eds. Marian Bubak, Jacek Kitowski, Kazimierz Wiatr. — Switzerland : Springer International Publishing, cop. 2014 + CD. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 8500. Information Systems and Applications, incl. Internet/Web, and HCI). — ISBN: 978-3-319-10893-3 ; e-ISBN: 978-3-319-10894-0. — S. 164–177. — Bibliogr. s. 175–177, Abstr.

  • keywords: data management, metadata recording, storage infrastructures, data sharing, reproducibility, discoverability

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Daniel Harężlak, Maciej Pawlik, Bartosz Wilk

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

3
4

  • Building collaborative applications for system-level science / Marian BUBAK, Tomasz GUBAŁA, Marek KASZTELNIK, Maciej MALAWSKI // W: High speed and large scale scientific computing / eds. Wolfgang Gentzsch, Lucio Grandinetti, Gerhard Joubert. — Amsterdam : IOS Press, cop. 2009. — (Advances in Parallel Computing ; ISSN 0927-5452 ; vol. 18). — ISBN: 978-1-60750-073-5. — S. 299–310. — Bibliogr. s. 309–310, Abstr.. — M. Bubak – dod. afiliacja: Informatics Institute, University of Amsterdam

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Maciej Malawski, Tomasz Gubała

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

5

  • Centre for new methods in computational diagnostics and personalized therapy / Marian BUBAK, Bartosz BALIŚ, Tomasz BARTYŃSKI, Eryk CIEPIELA, Grzegorz DYK, Tomasz GUBAŁA, Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Joanna KOCOT, Maciej MALAWSKI, Jan MEIZNER, Piotr NOWAKOWSKI, Maciej PAWLIK, Katarzyna RYCERZ, Paweł SUDER, Tomasz SZEPIENIEC, Bartosz WILK // W: CGW Workshop'17 : Kraków, Poland, October 23-25, 2017 : proceedings / eds. Marian Bubak, Michał Turała, Kazimierz Wiatr. — Kraków : Academic Computer Centre CYFRONET AGH, [2017]. — ISBN: 978-83-61433-24-8. — S. 67–68. — Bibliogr. s. 68. — Toż. na: {http://www.eurvalve.eu/wp-content/uploads/2017/11/Cyfronet-%C5%9Brodek_Proceedings.pdf}. — Dod. na stronie konferencji prezentacja {http://www.cyfronet.krakow.pl/cgw17/presentations/S8_5-M-Bubak.pdf}

  • keywords: personalized medicine, teaming, centre of excellence, computational medicine, business plan, H2020, Polish Smart Specialization Strategy

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

6
7

  • Computations of protein hydrophobicity profile as virtual experiment in GridSpace virtual laboratory / Eryk CIEPIELA, Tomasz JADCZYK, Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Piotr NOWAKOWSKI, Grzegorz DYK, Maciej MALAWSKI, Marian BUBAK, Irena Roterman // Bio-Algorithms and Med-Systems / Jagiellonian University. Medical College ; ISSN 1895-9091. — 2012 vol. 8 no. 4, s. 361–372. — Bibliogr. s. 371–372, Abstr.

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

8
9

  • Digital twin simulation development and execution on HPC infrastructures / Marek KASZTELNIK, Piotr NOWAKOWSKI, Jan MEIZNER, Maciej MALAWSKI, Adam Nowak, Krzysztof Gadek, Karol Zając, Antonino Amedeo La Mattina, Marian Bubak // W: Computational Science – ICCS 2023 : 23rd international conference : Prague, Czech Republic, July 3–5, 2023 : proceedings, Pt. 2 / eds. Jiří Mikyška [et al.]. — Cham, Switzerland : Springer, cop. 2023. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 14074). — ISBN: 978-3-031-36020-6 ; e-ISBN: 978-3-031-36021-3. — S. 18–32. — Bibliogr., Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2023-06-26. — P. Nowakowski, J. Meizner, M. Malawski - dod. afiliacja: Sano Centre for Computational Medicine, Kraków

  • keywords: HPC, personalized medicine, digital execution environment, digital shadow

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Maciej Malawski, Piotr Nowakowski, Jan Meizner

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1007/978-3-031-36021-3_2

10

  • Effect of particularisation size on the accuracy and efficiency of a multiscale tumours' growth model / Vinicius Varella, Barbara de M. Quintela, Marek KASZTELNIK, Marco Viceconti // International Journal for Numerical Methods in Biomedical Engineering ; ISSN 2040-7939. — 2022 vol. 38 iss. 12 art. no. e3657, s. 1–9. — Bibliogr. s. 9, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2022-10-25. — tekst: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1002/cnm.3657

  • keywords: modelling, oncology, in silico, multi-scale, homogenisation, particularisation

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1002/cnm.3657

11
12

  • Evaluation of cloud providers for VPH applications / Marian BUBAK, Marek KASZTELNIK, Maciej MALAWSKI, Jan MEIZNER, Piotr NOWAKOWSKI, Susheel Varma // W: CCGrid 2013 [Dokument elektroniczny] : 13th IEEE/ACM international symposium on Cluster, cloud, and grid computing : 13–16 May 2013, Delft : proceedings / eds. Pavan Balaji, Dick Epema, Thomas Fahringer. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — [Los Alamitos] : IEEE, cop. 2013. — ISBN: 978-0-7695-4996-5. — S. 200–201. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 201, Abstr.. — tekst: http://ieeexplore.ieee.org/stamp/stamp.jsp?tp=&arnumber=6546092

  • keywords: cloud computing, scientific applications, performance evaluation, Virtual Physiological Human

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Maciej Malawski, Piotr Nowakowski, Jan Meizner

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1109/CCGrid.2013.54

13

  • Execution management and efficient resource provisioning for flood decision support / Bartosz BALIŚ, Marek KASZTELNIK, Maciej MALAWSKI, Piotr NOWAKOWSKI, Bartosz WILK, Maciej PAWLIK, Marian BUBAK // Procedia Computer Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1877-0509. — 2015 vol. 51, s. 2377–2386. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 2385–2386, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2015-06-01. — International Conference On Computational Science : ICCS 2015 Computational Science at the Gates of Nature. — tekst: http://goo.gl/DRNpeY

  • keywords: cloud computing, resource provisioning, scientific workflows, urgent computing, flood decision support, flood threat assessment, execution management

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Bartosz Baliś, Maciej Malawski, Piotr Nowakowski, Maciej Pawlik, Bartosz Wilk

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1016/j.procs.2015.05.412

14

  • Grid Resource Registry – abstract layer for computational resources — Grid Resource Registry – zunifikowany dostęp do zasobów obliczeniowych / Marek KASZTELNIK, Marian BUBAK // Computer Science ; ISSN 1508-2806. — 2011 vol. 12, s. 33–44. — Bibliogr. s. 43–44. — tekst: http://journals.bg.agh.edu.pl/COMPUTER/2011/cs2011-03.pdf

  • słowa kluczowe: e-science, kolaboratywne tworzenie aplikacji, aplikacje rozproszone, odnajdywanie zasobów, rejestr, wspólna przestrzeń danych

    keywords: e-science, collaborative applications, distributed applications, resource discovery, registry, common information space

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

15

  • High-level API for managing computations on the HPC systems / Marek KASZTELNIK, Tomasz GUBAŁA, Piotr NOWAKOWSKI, Jan MEIZNER, Piotr POŁEĆ, Maciej MALAWSKI, Marian BUBAK // W: KU KDM 2022 : fourteenth ACC Cyfronet AGH HPC users' conference : online, 7-8 April 2022 : proceedings / eds. Kazimierz Wiatr, Jacek Kitowski, Marian Bubak. — Kraków : Academic Computer Centre Cyfronet AGH, 2022. — ISBN: 978-83-61433-40-8. — S. 23–24. — Bibliogr. s. 24. — T. Gubała, P. Nowakowski, J. Meizner, M. Malawski, M. Bubak - dod. afiliacja: Sano Centre for Computational Medicine, Krakow, Poland

  • keywords: PLGrid, MEE, GridFTP, GSI SSH, REST API

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Maciej Malawski, Piotr Nowakowski, Tomasz Gubała, Jan Meizner, Piotr Połeć

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

16
17

  • Managing entire lifecycles of e-science applications in the GridSpace2 virtual laboratory – from motivation through idea to operable Web-accessible environment built on top of PL-Grid e-infrastructure / Eryk CIEPIELA, Piotr NOWAKOWSKI, Joanna KOCOT, Daniel HARĘŻLAK, Tomasz GUBAŁA, Jan MEIZNER, Marek KASZTELNIK, Tomasz BARTYŃSKI, Maciej MALAWSKI, Marian BUBAK // W: Building a national distributed e-infrastructure – PL-Grid : scientific and technical achievements / eds. Marian Bubak, Tomasz Szepieniec, Kazimierz Wiatr. — Berlin ; Heidelberg : Springer-Verlag, cop. 2012. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 7136. Information Systems and Applications, incl. Internet/Web, and HCI). — Na okł. dod.: State-of-the-art survey ; Applications, Development and execution tools, VO and security systems, Basic services, Grid resources. — ISBN: 978-3-642-28266-9. — S. 228–239. — Bibliogr. s. 238–239, Abstr.. — T. Gubała, M. Bubak – dod. afiliacja: University of Amsterdam

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

18

  • PRIMAGE project: predictive \emph{in silico} multiscale analytics to support childhood cancer personalised evaluation empowered by imaging biomarkers / Luis Martí-Bonmatí, [et al.], Marian BUBAK, [et al.], Tomasz GUBAŁA, Marek KASZTELNIK, Jan MEIZNER, Piotr NOWAKOWSKI, [et al.] // European Radiology Experimental [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 2509-9280. — 2020 vol. 4 iss. 1 art. no. 22, s. 1–11. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 10–11, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2020-04-03. — tekst: https://eurradiolexp.springeropen.com/track/pdf/10.1186/s41747-020-00150-9

  • keywords: tumor, cloud computing, biomarkers, artificial intelligence, diffuse intrinsic pontine glioma, neuroblastoma

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Piotr Nowakowski, Tomasz Gubała, Jan Meizner

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1186/s41747-020-00150-9

19

  • Scripting language extensions offered by the GridSpace experiment platform / Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Eryk CIEPIELA, Marian BUBAK // W: Building a national distributed e-infrastructure – PL-Grid : scientific and technical achievements / eds. Marian Bubak, Tomasz Szepieniec, Kazimierz Wiatr. — Berlin ; Heidelberg : Springer-Verlag, cop. 2012. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 7136. Information Systems and Applications, incl. Internet/Web, and HCI). — Na okł. dod.: State-of-the-art survey ; Applications, Development and execution tools, VO and security systems, Basic services, Grid resources. — ISBN: 978-3-642-28266-9. — S. 217–227. — Bibliogr. s. 226–227, Abstr.

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Eryk Ciepiela, Daniel Harężlak

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

20

  • Seamlessly managing HPC workloads through Kubernetes / Sergio López-Huguet, J. Damià Segrelles, Marek KASZTELNIK, Marian BUBAK, Ignacio Blanquer // W: High performance computing : ISC high performance 2020 : international workshops : Frankfurt, Germany, June 21–25, 2020 : revised selected papers / eds.  Heike Jagode, [et al.]. — Cham: Springer Nature Switzerland AG, cop. 2020. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 12321. Theoretical Computer Science and General Issues ; ISSN 2512-2010). — ISBN: 978-3-030-59850-1 ; e-ISBN: 978-3-030-59851-8. — S. 310–320. — Bibliogr., Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2020-10-20

  • keywords: Kubernetes, docker and singularity containers, integrating cloud and HPC

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1007/978-3-030-59851-8_20

21

  • Secure file storage and access mechanisms in a multi-tenant environment / Jan MEIZNER, Marian BUBAK, Tomasz GUBAŁA, Marek KASZTELNIK, Maciej MALAWSKI, Piotr NOWAKOWSKI // W: KU KDM 2022 : fourteenth ACC Cyfronet AGH HPC users' conference : online, 7-8 April 2022 : proceedings / eds. Kazimierz Wiatr, Jacek Kitowski, Marian Bubak. — Kraków : Academic Computer Centre Cyfronet AGH, 2022. — ISBN: 978-83-61433-40-8. — S. 21–22. — Bibliogr. s. 22. — J. Meizner, M. Bubak, T. Gubała, M. Malawski, P. Nowakowski - dod. afiliacja: Sano Centre for Computational Medicine, Krakow, Poland

  • keywords: security, HPC, FUSE, clouds, webdav, file storage

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Maciej Malawski, Piotr Nowakowski, Tomasz Gubała, Jan Meizner

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

22

  • Smart levee monitoring and flood decision support system: reference architecture and urgent computing management / Bartosz BALIŚ, Tomasz BARTYŃSKI, Marian BUBAK, Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Maciej MALAWSKI, Piotr NOWAKOWSKI, Maciej PAWLIK, Bartosz WILK // Procedia Computer Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1877-0509. — 2017 vol. 108, s. 2220–2229. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 2228–2229, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2017-06-09. — ICCS 2017 : International Conference on Computational Science : 12–14 June 2017, Zurich, Switzerland. — tekst: https://goo.gl/a5dXx1

  • keywords: urgent computing, flood decision support, smart levee monitoring, reference architecture

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1016/j.procs.2017.05.192

23

  • Support for Taverna workflows in the VPH-Share cloud platform / Marek KASZTELNIK, Ernesto Coto, Marian BUBAK, Maciej MALAWSKI, Piotr NOWAKOWSKI, Juan Arenas, Alfredo Saglimbeni, Debora Testi, Alejandro F. Frangi // Computer Methods and Programs in Biomedicine ; ISSN 0169-2607. — 2017 vol. 146, s. 37–46. — Bibliogr. s. 45–46, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 20-05-2017. — M. Bubak, M. Malawski - dod. afiliacja: ACC Cyfronet AGH. — tekst: https://goo.gl/Q9cykt

  • keywords: taverna workflow, VPH share, atmosphere cloud, RESTful API

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Maciej Malawski, Piotr Nowakowski

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1016/j.cmpb.2017.05.006

24
25

  • The Collage Authoring Environment / Piotr NOWAKOWSKI, Eryk CIEPIELA, Daniel HARĘŻLAK, Joanna KOCOT, Marek KASZTELNIK, Tomasz BARTYŃSKI, Jan MEIZNER, Grzegorz Dyk, Maciej MALAWSKI // Procedia Computer Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1877-0509. — 2011 vol. 4 spec. iss., s. 608–617. — Bibliogr. s. 617, Abstr.. — Dod. afiliacja M. Malawski: Center for Research Computing, University of Notre Dame, USA. — W spisie treści informacja: Original Research Article. — ICCS 2011 : proceedings of the International Conference on Computational Science : Singapore, Japan, June 1–3, 2011

  • keywords: high performance computing, scientific publishing, executable paper, e-Science

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1016/j.procs.2011.04.064